55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1420 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1420  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1227  protein of unknown function DUF477  71.63 
 
 		 215 aa  311  4.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1258  protein of unknown function DUF477  70.23 
 
 		 215 aa  277  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.255338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2528  hypothetical protein  28.64 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0415  protein of unknown function DUF477  29.49 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2034  hypothetical protein  27.49 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2020  hypothetical protein  27.14 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000109583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0813  hypothetical protein  26.39 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1771  hypothetical protein  27.56 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2025  protein of unknown function DUF477  26.73 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1300  hypothetical protein  27.36 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0959913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2362  protein of unknown function DUF477  27.1 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0549587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2278  hypothetical protein  27.83 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1045  hypothetical protein  26.07 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4288  hypothetical protein  26.79 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2030  protein of unknown function DUF477  28.74 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0918  protein of unknown function DUF477  29.05 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0411456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0869  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0914  protein of unknown function DUF477  28.49 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0395  hypothetical protein  23.64 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1752  hypothetical protein  23.36 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1820  hypothetical protein  23.36 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1373  hypothetical protein  28.24 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000592916  hitchhiker  0.000147717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1083  hypothetical protein  26.73 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4407  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.809369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3991  hypothetical protein  25.7 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296881  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4319  hypothetical protein  25.12 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1404  hypothetical protein  26.21 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1223  protein of unknown function DUF477  32.67 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1796  protein of unknown function DUF477  26.42 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0823313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1822  protein of unknown function DUF477  27.75 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0121907  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2295  protein of unknown function DUF477  31.52 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2421  protein of unknown function DUF477  26.67 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2018  hypothetical protein  30.43 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3480  hypothetical protein  23.47 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4748  hypothetical protein  29.73 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0550887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  35.56 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  36.67 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1479  hypothetical protein  33.09 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0815961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3876  hypothetical protein  32.99 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47050  hypothetical protein  22.97 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1980  protein of unknown function DUF477  29.35 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  34.88 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  37.35 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  30.59 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  29.76 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  29.76 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6374  hypothetical protein  34.65 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.437942  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  29.76 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3228  hypothetical protein  24.89 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04651  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.024621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  29.76 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  29.76 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0926  hypothetical protein  28.74 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  29.76 
 
 		 290 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>