43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0452 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0452  TOBE domain protein  100 
 
 
133 aa  259  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424137  normal  0.700123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0415  TOBE domain protein  51.52 
 
 
150 aa  140  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333016  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0373  TOBE domain protein  37.8 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  39.37 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  37.4 
 
 
142 aa  84.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0439  TOBE domain-containing protein  35.43 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1718  TOBE domain protein  32.56 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.57263  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0316  hypothetical protein  26.4 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.648442  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.83 
 
 
265 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  29.49 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 
262 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.21 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  34.38 
 
 
262 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.04 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1283  hypothetical protein  25.4 
 
 
129 aa  47  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  28.21 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  30.08 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0583  molybdenum import ATP-binding protein ModC  25.98 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0361  hypothetical protein  28.43 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.94 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  33.62 
 
 
278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  33.62 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  33.62 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  30.09 
 
 
265 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.44 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  33.09 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  28.83 
 
 
261 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  26.32 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2205  beta-lactamase HcpA  25.2 
 
 
129 aa  42  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  33.63 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  36.25 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  35.37 
 
 
269 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
268 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1743  TOBE domain-containing protein  36.36 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  28.36 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 
359 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  32.59 
 
 
278 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  31.36 
 
 
278 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  30.3 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  31.51 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  30.77 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  30.77 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>