25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2642 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1368  hypothetical protein  56.41 
 
 
117 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0820  hypothetical protein  70.59 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0617234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  45.69 
 
 
118 aa  110  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0532  hypothetical protein  43.97 
 
 
117 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.330489  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  42.74 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5087  hypothetical protein  41.74 
 
 
118 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115983  normal  0.14262 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3520  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  38.75 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  29.63 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4618  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  36.25 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  25.77 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  36.25 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  29.82 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  45 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  29.81 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  28.97 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3727  hypothetical protein  46.3 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  36.71 
 
 
247 aa  40.8  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  36.84 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  30.21 
 
 
122 aa  40  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  36.73 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>