51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1822 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1822  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  807    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1010  glycosyl transferase group 1  62.11 
 
 
391 aa  537  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.513267  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0478  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521551  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  28.42 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
373 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
392 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.96 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
375 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
412 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
543 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  29.57 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.64 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  21.81 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  30.77 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  24.08 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  30.34 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  21.81 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.81 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1973  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.81 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  25 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.32 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  26.06 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.81 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05020  glycosyltransferase  36.11 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
383 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
386 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 
356 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
388 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>