33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0487 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  58.43 
 
 
266 aa  328  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  58.17 
 
 
263 aa  319  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  54.37 
 
 
259 aa  295  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  56.35 
 
 
248 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  34.4 
 
 
269 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  35.6 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  37.1 
 
 
247 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  34.82 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  33.06 
 
 
302 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  28.96 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  25.48 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3588  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0475559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  28.7 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1345  hypothetical protein  27.12 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00134896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1323  hypothetical protein  23.19 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1682  hypothetical protein  24.29 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.450349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  22.56 
 
 
1793 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00038  hypothetical protein  25.69 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  25.44 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1740  hypothetical protein  23.35 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1101  hypothetical protein  26.79 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3496  hypothetical protein  24.52 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>