More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0442 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0442  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.91 
 
 
226 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.676119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1542  putative transmembrane protein  70.09 
 
 
226 aa  287  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.73 
 
 
235 aa  280  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.14 
 
 
230 aa  228  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000677885  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0154  molybdenum ABC-transporter, permease protein (ModB)-like  50.93 
 
 
222 aa  205  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.491553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2673  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  52.88 
 
 
231 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.811966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0552  molybdate ABC transporter, permease protein  47.96 
 
 
223 aa  177  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000347277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2102  molybdate ABC transporter, permease protein  47.69 
 
 
219 aa  175  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50720  ABC transporter, permease protein  56.34 
 
 
231 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1444  molybdate ABC transporter permease  52.85 
 
 
230 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
221 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187571  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
224 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  41.5 
 
 
222 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  41 
 
 
225 aa  139  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  38.95 
 
 
238 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
221 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
221 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.69 
 
 
221 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  38.42 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  38.95 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 
274 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.38 
 
 
230 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
221 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.58 
 
 
227 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
225 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
228 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  39.56 
 
 
226 aa  122  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 
224 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
228 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  38.42 
 
 
225 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
225 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
221 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
235 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
231 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4340  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
226 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.991243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
223 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2559  molybdate ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0786903  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  36.46 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.37 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.66 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
224 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.9 
 
 
226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
628 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  36.95 
 
 
537 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  32.73 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
226 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 
224 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2053  molybdate ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
218 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.23 
 
 
226 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2341  molybdate ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 
218 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.302761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  37.85 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  37.85 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  32.23 
 
 
266 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  34.74 
 
 
279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 
224 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 
224 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  37.85 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
224 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  32.51 
 
 
266 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 
266 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4253  molybdate ABC transporter permease protein  36.93 
 
 
227 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  38.76 
 
 
228 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  32.2 
 
 
278 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  34.92 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  33.67 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  32.55 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  34.39 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.66 
 
 
220 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  36.57 
 
 
232 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>