More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2418 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2418  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
329 aa  670    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2582  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  82.87 
 
 
329 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.69072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  82.87 
 
 
330 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  76.9 
 
 
331 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2059  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.38 
 
 
329 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.894151  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2444  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.62 
 
 
328 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2176  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  72.26 
 
 
329 aa  497  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.63 
 
 
333 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.85 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
350 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3011  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.3 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000165502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.52 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.37 
 
 
348 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.06 
 
 
348 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
349 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.26 
 
 
346 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.85 
 
 
348 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1266  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
366 aa  308  6.999999999999999e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.26065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.19 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.32 
 
 
344 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.08 
 
 
340 aa  305  6e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.3 
 
 
350 aa  305  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.47 
 
 
339 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.46 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.39 
 
 
345 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.4 
 
 
353 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.94 
 
 
346 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.87 
 
 
358 aa  299  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.24 
 
 
348 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.39 
 
 
350 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.65 
 
 
336 aa  295  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.43 
 
 
346 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.69 
 
 
353 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.29 
 
 
345 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.21 
 
 
347 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.4 
 
 
352 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.06 
 
 
347 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.26 
 
 
356 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.69 
 
 
345 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.39 
 
 
352 aa  291  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1255  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.54 
 
 
345 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.39 
 
 
363 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.25 
 
 
352 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.55 
 
 
352 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.65 
 
 
346 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.76 
 
 
346 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2702  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
345 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00227816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2608  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.67 
 
 
352 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_002936  DET1416  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.38 
 
 
340 aa  287  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.578384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.09 
 
 
345 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.18 
 
 
379 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.81 
 
 
349 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.45 
 
 
352 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.45 
 
 
352 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.45 
 
 
352 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.97 
 
 
346 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.45 
 
 
352 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.39 
 
 
346 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.62 
 
 
352 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.65 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.08 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
354 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
352 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.61 
 
 
363 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.62 
 
 
351 aa  285  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.23 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.15 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.98 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.24 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.78 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.48 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.35 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.08 
 
 
357 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.11 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.29 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1197  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.92 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.11 
 
 
359 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0202  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.26 
 
 
350 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0422268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.29 
 
 
346 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.35 
 
 
341 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.73 
 
 
345 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.18 
 
 
369 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.85 
 
 
347 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.82 
 
 
347 aa  279  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.88 
 
 
356 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.31 
 
 
355 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.82 
 
 
347 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.21 
 
 
345 aa  278  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.73 
 
 
350 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1681  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.55 
 
 
347 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.44 
 
 
359 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.44 
 
 
359 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
345 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.34 
 
 
346 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.71 
 
 
346 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>