152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2355 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2355  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 358 aa  738    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0203  aminoglycoside phosphotransferase  65.97 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2760  aminoglycoside phosphotransferase  57.01 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2006  hypothetical protein  50.76 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0192  hypothetical protein  53.14 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0264  aminoglycoside phosphotransferase  48.77 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.62236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0235  aminoglycoside phosphotransferase  50.81 
 
 		 333 aa  305  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  35.2 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  32.48 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  32.15 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  30.31 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  30.5 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  30.36 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3762  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  31.51 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  30.55 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  28.49 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  31.88 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  27.38 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  28.33 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  30.12 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  29.21 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  29.21 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  30.69 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  28.31 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  31.68 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  28.71 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  29.3 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  28.84 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  28.29 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  28.39 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  31.29 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  28.36 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  30.24 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  27.9 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  27.7 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  28.43 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  27.85 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  29.32 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  27.67 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  28.19 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  26.69 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  26.37 
 
 		 427 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  29.49 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  28.78 
 
 		 514 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  27.81 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  29.45 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  28.78 
 
 		 504 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  30.84 
 
 		 529 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 		 327 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  27.15 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  30.72 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>