44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0837 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  100 
 
 		 347 aa  698    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  77.88 
 
 		 245 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  42.57 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  42.61 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  44.51 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  40.69 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  39.84 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  42.32 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  39.66 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  41.6 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  39.72 
 
 		 374 aa  242  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  39.55 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  39.58 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  38.2 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  37.71 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  40.86 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  37.25 
 
 		 426 aa  226  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  37.68 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  37.68 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  37.68 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  37.39 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  37.92 
 
 		 378 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  36.15 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  36.16 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  35.28 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  35.16 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  34.89 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  33.33 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  33.79 
 
 		 363 aa  198  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  35.05 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  41.28 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  31.16 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  29 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  54.05 
 
 		 85 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  30.7 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  38.81 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  33.04 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  26.89 
 
 		 936 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.43 
 
 		 995 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  25.73 
 
 		 932 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  25.73 
 
 		 932 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  22.5 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4557  hypothetical protein  32.76 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  25.94 
 
 		 936 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>