More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0295 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  100 
 
 
129 aa  264  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  68.5 
 
 
130 aa  190  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  67.97 
 
 
131 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  68 
 
 
132 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  66.4 
 
 
130 aa  184  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  67.19 
 
 
131 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  67.46 
 
 
131 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  62.79 
 
 
132 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  53.12 
 
 
167 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  52.38 
 
 
185 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  51.22 
 
 
133 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
151 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  47.97 
 
 
143 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
139 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
133 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45 
 
 
187 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  46.09 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  43.9 
 
 
451 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
132 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
132 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
132 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  40.98 
 
 
464 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  45.53 
 
 
447 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
128 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
152 aa  90.5  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  38.06 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  37.04 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  37.21 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  39.67 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  38.46 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  39.69 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.85 
 
 
480 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  43.16 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  37.59 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  42.55 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  43.01 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  36.92 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  36.09 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  39.84 
 
 
468 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  33.85 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  36.84 
 
 
490 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  43.01 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  34.88 
 
 
512 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  44.79 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  43.48 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  43.75 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  33.85 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  42.55 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  38.64 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  41.84 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  35.46 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  39.84 
 
 
472 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  38.1 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  33.85 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  32.58 
 
 
461 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  36.15 
 
 
170 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  32.03 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  40 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4715  rfaE bifunctional protein  38 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2543  rfaE bifunctional protein  40.62 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  43.75 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  34.15 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  36.17 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2014  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.64 
 
 
476 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000918296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  43.16 
 
 
487 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0715  rfaE bifunctional protein  44.21 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.970718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  42.11 
 
 
488 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.09 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  42.11 
 
 
490 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  33.57 
 
 
479 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  35.94 
 
 
458 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  32.06 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  33.07 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  36.36 
 
 
495 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  40 
 
 
455 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  42.11 
 
 
487 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  38.95 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  36.27 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4289  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.11 
 
 
476 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0800  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.88 
 
 
475 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  40 
 
 
490 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  36 
 
 
173 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0645  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.11 
 
 
476 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0564  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.11 
 
 
476 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.38 
 
 
482 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0292  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.11 
 
 
476 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  41.05 
 
 
491 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  38.54 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4011  transketolase  49.15 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  41.76 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  35.79 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3460  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.09 
 
 
477 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3454  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.09 
 
 
477 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3390  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.09 
 
 
477 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.793507  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  37.11 
 
 
358 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  37.11 
 
 
358 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>