46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12550 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  59.9 
 
 		 201 aa  251  5.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  52.94 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  40.64 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  39.89 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  42.7 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  33.52 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  37.85 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  33.52 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  32.47 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  35.8 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  35.8 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  30.9 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  30.9 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  31.67 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  29.83 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  35.56 
 
 		 177 aa  91.7  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  31.05 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  29.95 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  32.37 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  25.42 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  32.18 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  29.21 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  28.19 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  28.26 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  29.28 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  26.7 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  29.34 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  28.89 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  31.35 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  27.84 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  29.12 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  27.78 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  24.63 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf017  hypothetical protein  26.8 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  27.01 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00610  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 173 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  24.43 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>