More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01110 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01110  peroxiredoxin  100 
 
 
187 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25090  peroxiredoxin  78.61 
 
 
187 aa  308  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0502073  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0908  peroxiredoxin  76.47 
 
 
187 aa  304  4.0000000000000004e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000179552  normal  0.606862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2301  peroxiredoxin  71.12 
 
 
187 aa  295  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.701051  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0476  peroxiredoxin  67.91 
 
 
187 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0784  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  66.31 
 
 
187 aa  275  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1407  peroxiredoxin  64.71 
 
 
187 aa  273  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0341  peroxiredoxin  63.64 
 
 
187 aa  255  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0119285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1125  peroxiredoxin  63.49 
 
 
188 aa  254  3e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45910  Alkyl hydroperoxide reductase  60.43 
 
 
187 aa  253  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1205  hypothetical protein  58.29 
 
 
187 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  4.64987e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0829  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  60.75 
 
 
189 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.520161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5403  peroxiredoxin  57.22 
 
 
187 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123087  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  58.29 
 
 
187 aa  247  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3325  alkyl hydroperoxide reductase/Thiol specific antioxidant/Mal allergen  58.6 
 
 
189 aa  247  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1797  putative alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  60.22 
 
 
188 aa  247  7e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0928  peroxiredoxin  59.68 
 
 
189 aa  247  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1450  peroxiredoxin  61.29 
 
 
189 aa  247  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000353338  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0896  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.68 
 
 
189 aa  247  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3444  peroxiredoxin  59.68 
 
 
189 aa  246  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0958  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  59.14 
 
 
189 aa  246  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0801  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.6 
 
 
189 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3222  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.6 
 
 
189 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3638  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.68 
 
 
189 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3517  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.68 
 
 
189 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2095  alkyl hydroperoxide reductase protein  57.75 
 
 
187 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0849  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.68 
 
 
205 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.68 
 
 
188 aa  245  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832179  normal  0.5898 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2139  peroxiredoxin  59.68 
 
 
188 aa  245  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.441627  hitchhiker  0.00203852 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0522  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.6 
 
 
189 aa  244  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0792  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.06 
 
 
189 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.124423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0942  peroxiredoxin  59.36 
 
 
187 aa  244  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0003  peroxiredoxin  59.89 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000147227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1418  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.75 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.14 
 
 
189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.956436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3012  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.06 
 
 
189 aa  241  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0617  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  56.99 
 
 
189 aa  241  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0602  peroxiredoxin  60.22 
 
 
188 aa  239  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1102  peroxiredoxin  57.22 
 
 
187 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.012958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3187  peroxiredoxin  53.48 
 
 
187 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1965  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.75 
 
 
187 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2439  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  55.08 
 
 
187 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.08 
 
 
187 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1072  peroxiredoxin  59.36 
 
 
187 aa  238  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000624433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3657  peroxiredoxin  55.08 
 
 
187 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1316  normal  0.64975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3534  peroxiredoxin  55.08 
 
 
187 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.734574  normal  0.05332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2401  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60 
 
 
190 aa  237  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.548664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03180  peroxiredoxin  57.75 
 
 
187 aa  236  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2519  peroxiredoxin  56.15 
 
 
187 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2369  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  57.75 
 
 
187 aa  235  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1066  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.38 
 
 
189 aa  235  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3501  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.55 
 
 
187 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4717  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  55.38 
 
 
189 aa  234  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0447  peroxiredoxin  57.22 
 
 
187 aa  234  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3984  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  233  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.682619  normal  0.347189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4495  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  233  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1833  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  55.61 
 
 
186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00340072  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1926  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  53.48 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5072  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  57.22 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.911201  normal  0.100881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1953  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830467  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2882  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  57.22 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000958869  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.15 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2810  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  54.84 
 
 
188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000162826 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2045  alkyl hydroperoxide reductase protein  54.01 
 
 
187 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3432  peroxiredoxin  53.48 
 
 
187 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0757  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  54.01 
 
 
187 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0667  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  54.01 
 
 
187 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.830328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4091  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2925  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  231  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333521  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3000  peroxiredoxin  55.61 
 
 
187 aa  230  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1786  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  53.48 
 
 
187 aa  230  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.998152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2046  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  53.48 
 
 
187 aa  230  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1197  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.45 
 
 
189 aa  230  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000854978  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0779  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  53.48 
 
 
187 aa  230  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.867109  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1072  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  53.48 
 
 
187 aa  230  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.61 
 
 
187 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21220  peroxiredoxin  52.41 
 
 
187 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00898795  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0766  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  56.15 
 
 
187 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3108  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  54.01 
 
 
187 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00552107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0647  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  56.15 
 
 
187 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0661  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  56.15 
 
 
187 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0439  peroxiredoxin  55.61 
 
 
187 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3044  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.26 
 
 
190 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0705  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  56.15 
 
 
187 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0720  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  56.15 
 
 
187 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0618  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  57.3 
 
 
188 aa  228  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0440  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  55.61 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0330  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.61 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0314  alkyl hydroperoxide reductase (peroxiredoxin)  55.61 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0317  alkyl hydroperoxide reductase  55.61 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0345  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.61 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  54.55 
 
 
187 aa  228  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0377  peroxiredoxin  55.61 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3019  peroxiredoxin  55.08 
 
 
187 aa  228  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0691  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.08 
 
 
187 aa  228  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.759293  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0519  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.08 
 
 
187 aa  228  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.08 
 
 
187 aa  228  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0657  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.08 
 
 
187 aa  228  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3038  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  55.08 
 
 
187 aa  228  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>