More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0784 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0784  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  100 
 
 
187 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0476  peroxiredoxin  79.14 
 
 
187 aa  315  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5403  peroxiredoxin  72.73 
 
 
187 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123087  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1205  hypothetical protein  73.26 
 
 
187 aa  297  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  4.64987e-18  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3657  peroxiredoxin  72.19 
 
 
187 aa  292  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1316  normal  0.64975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0602  peroxiredoxin  70.43 
 
 
188 aa  289  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4495  peroxiredoxin  70.05 
 
 
187 aa  288  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3501  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.59 
 
 
187 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3984  peroxiredoxin  70.05 
 
 
187 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.682619  normal  0.347189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0341  peroxiredoxin  70.59 
 
 
187 aa  287  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0119285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1953  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.52 
 
 
187 aa  286  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830467  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0958  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  69.35 
 
 
189 aa  285  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0896  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.35 
 
 
189 aa  285  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0801  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.82 
 
 
189 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3222  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.82 
 
 
189 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3517  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.82 
 
 
189 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3638  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.82 
 
 
189 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3444  peroxiredoxin  68.82 
 
 
189 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3325  alkyl hydroperoxide reductase/Thiol specific antioxidant/Mal allergen  68.82 
 
 
189 aa  284  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3432  peroxiredoxin  68.98 
 
 
187 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.98 
 
 
187 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4091  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.98 
 
 
187 aa  284  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0849  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.82 
 
 
205 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2095  alkyl hydroperoxide reductase protein  69.52 
 
 
187 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0792  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.28 
 
 
189 aa  283  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.124423 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0757  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  68.45 
 
 
187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2045  alkyl hydroperoxide reductase protein  68.45 
 
 
187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1926  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  67.91 
 
 
187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3012  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.2 
 
 
189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0522  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.2 
 
 
189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0667  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  68.45 
 
 
187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.830328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1066  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.28 
 
 
189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0779  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  67.91 
 
 
187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.867109  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1072  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  67.91 
 
 
187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1786  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  67.91 
 
 
187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.998152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2046  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  67.91 
 
 
187 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2810  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  67.2 
 
 
188 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000162826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0617  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  67.2 
 
 
189 aa  279  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.13 
 
 
189 aa  279  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.956436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0928  peroxiredoxin  67.2 
 
 
189 aa  278  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1407  peroxiredoxin  65.24 
 
 
187 aa  278  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0829  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  66.13 
 
 
189 aa  277  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.520161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4717  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  67.2 
 
 
189 aa  276  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1125  peroxiredoxin  70.9 
 
 
188 aa  276  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2401  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.79 
 
 
190 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.548664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1450  peroxiredoxin  62.9 
 
 
189 aa  271  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000353338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3187  peroxiredoxin  64.71 
 
 
187 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2439  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  65.24 
 
 
187 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.24 
 
 
187 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3534  peroxiredoxin  65.24 
 
 
187 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.734574  normal  0.05332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.31 
 
 
187 aa  269  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0908  peroxiredoxin  65.24 
 
 
187 aa  264  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000179552  normal  0.606862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2301  peroxiredoxin  64.17 
 
 
187 aa  263  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.701051  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3044  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.11 
 
 
190 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0647  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.64 
 
 
187 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0618  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  63.24 
 
 
188 aa  262  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45910  Alkyl hydroperoxide reductase  62.57 
 
 
187 aa  262  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0705  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.64 
 
 
187 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2925  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.57 
 
 
187 aa  262  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333521  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.1 
 
 
187 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0661  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.64 
 
 
187 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0720  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.64 
 
 
187 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0766  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.64 
 
 
187 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2975  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.1 
 
 
187 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244311  normal  0.019621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1145  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.64 
 
 
187 aa  261  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.731724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1797  putative alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  60.75 
 
 
188 aa  261  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00574  alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.355104  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3019  peroxiredoxin  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0691  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.759293  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0519  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3038  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00563  hypothetical protein  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0657  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  62.57 
 
 
187 aa  261  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3108  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  62.03 
 
 
187 aa  260  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00552107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1197  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.9 
 
 
189 aa  260  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000854978  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01110  peroxiredoxin  66.31 
 
 
187 aa  259  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3927  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.1 
 
 
187 aa  259  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3730  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  63.1 
 
 
187 aa  259  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01774  Peroxiredoxin  62.03 
 
 
187 aa  258  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21220  peroxiredoxin  62.57 
 
 
187 aa  258  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00898795  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04762  alkyl hydroperoxide reductase c22 protein  64.86 
 
 
185 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25090  peroxiredoxin  62.57 
 
 
187 aa  257  7e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0502073  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.68 
 
 
188 aa  257  7e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832179  normal  0.5898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1072  peroxiredoxin  62.03 
 
 
187 aa  256  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000624433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  60.96 
 
 
187 aa  256  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001044  alkyl hydroperoxide reductase protein C  64.32 
 
 
185 aa  255  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2139  peroxiredoxin  59.14 
 
 
188 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.441627  hitchhiker  0.00203852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2369  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  60.96 
 
 
187 aa  254  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4220  peroxiredoxin  60.96 
 
 
187 aa  254  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  62.57 
 
 
187 aa  253  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2882  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  60.43 
 
 
187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000958869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5072  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  60.96 
 
 
187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.911201  normal  0.100881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1102  peroxiredoxin  60.96 
 
 
187 aa  252  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.012958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0942  peroxiredoxin  61.5 
 
 
187 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0447  peroxiredoxin  61.5 
 
 
187 aa  250  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1418  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.5 
 
 
187 aa  250  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03180  peroxiredoxin  57.75 
 
 
187 aa  249  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0003  peroxiredoxin  58.82 
 
 
187 aa  248  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000147227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>