16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2709 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  100 
 
 		 1036 aa  2063    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  46.54 
 
 		 1059 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  40.1 
 
 		 1051 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  32.82 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  27.59 
 
 		 875 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  33.7 
 
 		 1041 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  24.63 
 
 		 682 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  25.37 
 
 		 687 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  31.08 
 
 		 808 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  27.68 
 
 		 985 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  35.23 
 
 		 803 aa  48.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  28.04 
 
 		 929 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  38.1 
 
 		 1006 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  22.07 
 
 		 796 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  22.13 
 
 		 810 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  31.03 
 
 		 874 aa  44.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>