More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0391 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  100 
 
 
94 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  86.17 
 
 
94 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 
94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
94 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3290  chaperonin Cpn10  70.97 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000053121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
96 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
95 aa  116  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  114  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 
94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  60 
 
 
95 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 
95 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
96 aa  110  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
94 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
103 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 
101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
95 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
94 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
94 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
94 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
96 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
95 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
97 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 
97 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
100 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
97 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 
102 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 
94 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
103 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
127 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
97 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
104 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
103 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
97 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
102 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
104 aa  103  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 
103 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
96 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
102 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
103 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
103 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  56.38 
 
 
103 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  56.99 
 
 
98 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  55.91 
 
 
96 aa  103  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
104 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
98 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
104 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
98 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
104 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
98 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
103 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
98 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
94 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
95 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
103 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  57.78 
 
 
103 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
95 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
104 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
98 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>