More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0271 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0271  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2607  F0F1 ATP synthase subunit gamma  57.14 
 
 
295 aa  328  9e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1425  ATP synthase F1, gamma subunit  45.97 
 
 
292 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  42.03 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.89 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 
281 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.83 
 
 
283 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
283 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  36.31 
 
 
308 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  40.48 
 
 
287 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.37 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
286 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  34.46 
 
 
295 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.35 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
285 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  35.49 
 
 
287 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.41 
 
 
290 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 
290 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  35.74 
 
 
287 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.5 
 
 
285 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
292 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.87 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.16 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
289 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.47 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  36.03 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
288 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.43 
 
 
288 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.02 
 
 
291 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  33.78 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.68 
 
 
291 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  34.87 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1775  ATP synthase F1, gamma subunit  34.88 
 
 
299 aa  178  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.95 
 
 
316 aa  176  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.23 
 
 
315 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
293 aa  175  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.81 
 
 
287 aa  175  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.8 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.8 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.71 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.8 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.48 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.59 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.23 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.11 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  30.91 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  32.99 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
289 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  34.98 
 
 
295 aa  171  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
287 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33 
 
 
286 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
288 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  32.73 
 
 
291 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.65 
 
 
293 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
286 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  30.84 
 
 
310 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.02 
 
 
286 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.18 
 
 
287 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  36.39 
 
 
285 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
286 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  35.22 
 
 
303 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  33 
 
 
286 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.68 
 
 
287 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
286 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.65 
 
 
288 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
287 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  33.67 
 
 
286 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.76 
 
 
286 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  35.02 
 
 
291 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.47 
 
 
288 aa  168  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.38 
 
 
314 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.91 
 
 
314 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.65 
 
 
287 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
287 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0083  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.07 
 
 
280 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
286 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0142  ATP synthase F1, gamma subunit  34.35 
 
 
287 aa  167  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
287 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.67 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.66 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>