298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4574 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  209  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  53.68 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  48.21 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  46.36 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  40.95 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  44.33 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  47.32 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  46.43 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  47.73 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  41.28 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  43.81 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  41.96 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  46.43 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  46.59 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  47.25 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  41.28 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  44.64 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  44.64 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.69 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  44.64 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  41.58 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  44.86 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  45.05 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  43.33 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  44.34 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  39.25 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.81 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  37.96 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  48.04 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  44.83 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1548  hypothetical protein  38.78 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0355812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  41.76 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  36.54 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  45.05 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  43.52 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  45.87 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  43.4 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  39.62 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.49 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  36.45 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  43.14 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  41.51 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  45.92 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  44 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  42.55 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  41.51 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  41.51 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  41.51 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  41.75 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  40.95 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  40.37 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  40.95 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  40.57 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  40.91 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  42.55 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  41.12 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  39.56 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  41.49 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  42.53 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  41.49 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>