43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2888 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  53.33 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  42.34 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.21 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.21 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  35.29 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.71 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.92 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1704  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.76 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  39.13 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.76 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40.58 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.86 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0767  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.78 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  29.31 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.03 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.82 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.69 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  33.88 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0373  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.88 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0341  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.43 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280279  normal  0.495498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  28.18 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0045  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.76 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  36.49 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.57 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  36.49 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4190  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1114  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.14 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.08 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  30.97 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.27 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.72 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  30.7 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3554  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.23 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.849284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.87 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.05 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0697  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.67 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.868775  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0279  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.36 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0686  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.67 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>