26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4436 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  87.6 
 
 		 122 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  84.3 
 
 		 122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  71.9 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  64.46 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  63.64 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  59.38 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  46.72 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  45.08 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  39.34 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  41.94 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  39.17 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  36.67 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  36.67 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.4 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.87 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.79 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.61 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.76 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  37.76 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.5 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0341  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.83 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280279  normal  0.495498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0767  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.42 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0373  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.96 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.16 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.67 
 
 		 124 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>