30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3827 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  98.45 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  69.42 
 
 		 125 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  69.17 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  42.24 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  41.38 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.14 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.75 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  37.86 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  31.97 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  31.15 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.61 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.23 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  29.51 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  29.51 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  32.35 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.61 
 
 		 122 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.77 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.95 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0781  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.87 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.88 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.7 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1114  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40.48 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.7 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.4 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.3 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.43 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  28.57 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.43 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>