34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3351 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  70.25 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  69.42 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  67.52 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  40 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  39.13 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.54 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.06 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  33.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  34.19 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  36.45 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.69 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.87 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.77 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  31.15 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  31.15 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  33.33 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.15 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.4 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0781  hypothetical protein  29.55 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.36 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.27 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.88 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.39 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.43 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.57 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.07 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1704  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.57 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0686  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.81 
 
 		 116 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0697  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.81 
 
 		 116 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.868775  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2846  hypothetical protein  26.53 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0767  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  25.22 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  27.16 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4190  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  24.49 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>