26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3798 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  89.34 
 
 		 122 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  84.3 
 
 		 122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  72.13 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  63.93 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  63.11 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  56.25 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  44.17 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  41.67 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  40.8 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  38.33 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.1 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  37.5 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  37.5 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  37.5 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.61 
 
 		 129 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.77 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.4 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  39.36 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.21 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40.54 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.37 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.78 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.72 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.72 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>