24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4202 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  43.22 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  46.15 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  46.15 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  43.69 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  39.42 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.93 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.11 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.62 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0697  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.94 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.868775  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0686  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.94 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.3 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.37 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40.54 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3554  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.71 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.849284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  30.17 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  31.67 
 
 		 121 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.2 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1704  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.93 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14519 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.67 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>