25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1492 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  76.23 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  71.9 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  72.13 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  59.5 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  59.5 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  54.17 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  43.7 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  42.02 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  38.33 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  38.02 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  39.52 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  33.88 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  33.88 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.77 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.95 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.07 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.03 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  37.63 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.03 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.01 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.01 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.5 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.43 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>