31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2549 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  100 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  45.45 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  43.8 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.6 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.94 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.94 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40.8 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.2 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  40.5 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  40.5 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.8 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.52 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.86 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  43.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  35.54 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  34.71 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.92 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.45 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  36.84 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.18 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.56 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.42 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.73 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.89 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.63 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4190  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.8 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.39 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.39 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  35.94 
 
 		 121 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  22.61 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0781  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>