22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1338 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  88.43 
 
 		 121 aa  223  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  76.04 
 
 		 96 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  63.64 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  64.75 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  63.11 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  59.5 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  43.7 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  41.18 
 
 		 121 aa  103  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  42.5 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  41.6 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  40.98 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  40.98 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  41.8 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.77 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.06 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.04 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  38.95 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.46 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.72 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0279  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.33 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>