34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2856 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  100 
 
 		 104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.35 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.65 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.95 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.13 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  38.46 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.76 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.36 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.3 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  37.23 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.84 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  36.84 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.41 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.41 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.63 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.84 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  32.22 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  32.22 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4190  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.07 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.95 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  33.78 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1704  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.18 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.26 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  30.53 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  30.38 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3554  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.56 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.849284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.1 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.07 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0045  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.18 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.11 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.85 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.85 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>