32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1963 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 
126 aa  256  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  53.33 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  40.98 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.17 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.9 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.42 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.39 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  31.37 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.88 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  35.71 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.46 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.03 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.21 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.88 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  30.56 
 
 
125 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  29.46 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.5 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.92 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.88 
 
 
129 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.92 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.46 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4190  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.11 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  31.09 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1114  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.72 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945974  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  29.41 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.88 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.45 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  29.41 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.57 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  27.68 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>