28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3743 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  98.45 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  70.25 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  68.33 
 
 		 127 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  42.24 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  41.38 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.44 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.04 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  35.92 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  31.97 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  31.97 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  31.15 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  31.15 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.79 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  32.65 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.11 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.77 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.93 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.07 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0781  hypothetical protein  29.29 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.05 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.77 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1114  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.29 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.63 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.63 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.29 
 
 		 115 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>