27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2973 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 123 aa  250  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  44.07 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.59 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.59 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  43.69 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.44 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.82 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  34.65 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.33 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.93 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.77 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1704  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  28.57 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  30.65 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.37 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  23.68 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  27.19 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  26.5 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  22.81 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  25.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.27 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  23.48 
 
 		 121 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26.13 
 
 		 121 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  24.35 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0767  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  26 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.33 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  31.34 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>