26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1619 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1619  flagellar FlaF family protein  100 
 
 		 121 aa  253  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4202  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.42 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3360  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.99 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.29 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  34.65 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.37 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1704  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.59 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14519 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.37 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0276  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  30.97 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.68 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.3 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.82 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  30.53 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4190  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  37.04 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1041  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1136  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0697  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.868775  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0686  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2846  hypothetical protein  28.12 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  35.94 
 
 		 125 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  28.57 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1114  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.89 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  27.16 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  31.08 
 
 		 342 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3554  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.21 
 
 		 91 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.849284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>