71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1662 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1662  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  100 
 
 
339 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0404  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  56.98 
 
 
372 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0372  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  56.98 
 
 
372 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423524  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0436  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  57.3 
 
 
371 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0472  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.92 
 
 
375 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0181  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.35 
 
 
364 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.5734  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1200  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.31 
 
 
367 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.811459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0492  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  55.99 
 
 
339 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.426416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0140  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.76 
 
 
368 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.878428  normal  0.626976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0191  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.8 
 
 
364 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4903  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.87 
 
 
377 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0399  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.23 
 
 
363 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0410  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.76 
 
 
385 aa  362  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332702  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0904  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.33 
 
 
388 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0218  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.48 
 
 
368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0792  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  53.2 
 
 
368 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1865  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.39 
 
 
361 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.016186  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0320  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.4 
 
 
383 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0306  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.4 
 
 
363 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0134  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.25 
 
 
365 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5250  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.92 
 
 
368 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0545  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.41 
 
 
358 aa  358  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7450  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.24 
 
 
361 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0097  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  50.14 
 
 
361 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6539  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  54.52 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1723  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.39 
 
 
364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621377  normal  0.251189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1915  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.39 
 
 
358 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.863389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2609  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.25 
 
 
358 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1267  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.25 
 
 
358 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1781  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.81 
 
 
361 aa  345  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2311  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  56.62 
 
 
374 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293691  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1017  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  50.27 
 
 
386 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0769  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  52.62 
 
 
368 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0826496  hitchhiker  0.00227183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0911  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  51.83 
 
 
359 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1037  2'-deoxycytidine 5'-triphosphate deaminase  47.67 
 
 
394 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.18 
 
 
200 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.29 
 
 
192 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.34 
 
 
197 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0327  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.17 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.3 
 
 
203 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.71 
 
 
196 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.53 
 
 
196 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.61 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1249  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.67 
 
 
179 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.22 
 
 
194 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.29 
 
 
194 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  24.38 
 
 
182 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 
191 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.41 
 
 
191 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.57 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.17 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  30.14 
 
 
196 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.15 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  28.38 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.21 
 
 
194 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.41 
 
 
216 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.15 
 
 
199 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.67 
 
 
193 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  24.69 
 
 
180 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.86 
 
 
196 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.87 
 
 
192 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.94 
 
 
191 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.72 
 
 
201 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  27.21 
 
 
193 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.38 
 
 
191 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0140  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.38 
 
 
171 aa  43.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.87 
 
 
192 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.17 
 
 
191 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  25.61 
 
 
177 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.58 
 
 
189 aa  42.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>