31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5220 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  100 
 
 		 723 aa  1440    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.74 
 
 		 1001 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1596  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  57.55 
 
 		 778 aa  685    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  78.99 
 
 		 1357 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  83.59 
 
 		 1176 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  79.7 
 
 		 682 aa  216  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  76.34 
 
 		 542 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  71.88 
 
 		 635 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0463  hypothetical protein  26.6 
 
 		 818 aa  179  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.177436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  70.31 
 
 		 632 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  60.9 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  60 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  52 
 
 		 358 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  52.76 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.61 
 
 		 673 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.41 
 
 		 734 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  41.27 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.9 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  31.29 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.07 
 
 		 603 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  35.11 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  45.16 
 
 		 1115 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.41 
 
 		 558 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  35.77 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1010 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  23.16 
 
 		 701 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  26.4 
 
 		 671 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2665  glycoside hydrolase family 35  34.92 
 
 		 534 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>