30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5022 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 388 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6991  hypothetical protein  51.27 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220253  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4103  hypothetical protein  50.88 
 
 		 342 aa  245  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2703  alkylhydroperoxidase  44.41 
 
 		 360 aa  239  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582162  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0545  alkylhydroperoxidase  42.11 
 
 		 369 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1760  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0293  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.23 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0845  alkylhydroperoxidase  34.28 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0548  carboxymuconolactone decarboxylase  39.12 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12189  hypothetical protein  36.22 
 
 		 344 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.25676e-41  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.35 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.71 
 
 		 180 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.55 
 
 		 201 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.79 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.73 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5896  hypothetical protein  27.71 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  27.46 
 
 		 144 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.62 
 
 		 188 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.12 
 
 		 176 aa  46.2  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.36 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.79 
 
 		 201 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.63 
 
 		 199 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  22.94 
 
 		 183 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  27.68 
 
 		 143 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.46 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.63 
 
 		 198 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.99 
 
 		 143 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.26 
 
 		 143 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.67 
 
 		 181 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>