27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4967 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  100 
 
 		 876 aa  1764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1321 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  28.98 
 
 		 1083 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1220 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1075 aa  93.2  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  23.3 
 
 		 952 aa  93.2  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1060 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  23.17 
 
 		 1084 aa  86.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  24.19 
 
 		 931 aa  82  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  24.17 
 
 		 931 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1147 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 983 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 1078 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1117 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1090 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1082 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1043 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.52 
 
 		 1041 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1054 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 999 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 1021 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.42 
 
 		 1060 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 1044 aa  53.5  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  30.11 
 
 		 912 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 931 aa  45.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.94 
 
 		 681 aa  44.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>