17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3739 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  49.22 
 
 		 1107 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  40.48 
 
 		 897 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  37.4 
 
 		 524 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  32.45 
 
 		 765 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.46 
 
 		 1577 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  50.94 
 
 		 763 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  51.85 
 
 		 818 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  49.18 
 
 		 430 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.47 
 
 		 550 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  38.96 
 
 		 720 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  47.17 
 
 		 743 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.03 
 
 		 848 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  43.64 
 
 		 760 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  48.78 
 
 		 430 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  44.23 
 
 		 420 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>