More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3209 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.228395  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  37.78 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2645  hypothetical protein  40.65 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4700  hypothetical protein  34.08 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3024  hypothetical protein  37.85 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.695841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2389  hypothetical protein  41.45 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.259885  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3769  hypothetical protein  37.78 
 
 		 440 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.96163  normal  0.0729973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  37.85 
 
 		 197 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6277  predicted protein  35.71 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.419157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38.89 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.564025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1153  hypothetical protein  36.87 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  35.96 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  34.66 
 
 		 194 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2040  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0660714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  32.34 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  37.14 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  38.6 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  37.29 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  35.93 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  37.64 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  36.11 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  39.22 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  36.52 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  36.52 
 
 		 193 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  34.83 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  36.52 
 
 		 193 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  34.09 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0909  hypothetical protein  35.75 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  39.47 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  34.09 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  33.71 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  39.47 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  39.47 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  39.47 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  39.47 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  37.06 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  36.14 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  39.47 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  39.47 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  34.66 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  36.52 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  35.23 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  38.82 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  34.09 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  34.84 
 
 		 206 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  36.52 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  36.18 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  35.23 
 
 		 184 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  39.6 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  32.95 
 
 		 199 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1454  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  34.19 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  34.46 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  34.39 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  32.68 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  40.56 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1841  hypothetical protein  37.14 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.086843  normal  0.221662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  31.79 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  32.73 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  37.75 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  35.76 
 
 		 200 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  38.41 
 
 		 198 aa  91.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  35.84 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  34.38 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  32.96 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  37.22 
 
 		 197 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  35.29 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  33.55 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  34.1 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  35.15 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  34.1 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  34.19 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  34.87 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  37.06 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  34.09 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8427  hypothetical protein  36.31 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  36.6 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  30.97 
 
 		 199 aa  89  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1393  hypothetical protein  32.95 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  33.99 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  33.11 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.87 
 
 		 221 aa  88.2  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  31.67 
 
 		 198 aa  87.8  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  36.18 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2867  hypothetical protein  32.5 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  33.53 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  32.89 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  32.89 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  33.56 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  34.12 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.03 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>