More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1252 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  73.36 
 
 		 443 aa  693    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  75.5 
 
 		 451 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  76.96 
 
 		 451 aa  717    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 455 aa  947    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  77.95 
 
 		 449 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  76.44 
 
 		 450 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  76.35 
 
 		 445 aa  738    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  77.95 
 
 		 449 aa  740    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  78.4 
 
 		 449 aa  742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  75.56 
 
 		 468 aa  722    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  70.4 
 
 		 441 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  79.33 
 
 		 443 aa  746    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  60.89 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  53.76 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  51.03 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  52.4 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  52.62 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  46.27 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  44.36 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  42.78 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  41.88 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  41.71 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  39.85 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  39.66 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 430 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  40.1 
 
 		 426 aa  279  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  40.35 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  40.61 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  39.35 
 
 		 428 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  40.36 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  38.37 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  39.69 
 
 		 431 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  39.25 
 
 		 432 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  38.25 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  35.88 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  36.19 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  42.79 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 		 338 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.73 
 
 		 342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.6 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.06 
 
 		 350 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 		 342 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 		 337 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.23 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  27.1 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.58 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.74 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 		 342 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 		 361 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.1 
 
 		 332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.29 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.12 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.92 
 
 		 342 aa  110  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.25 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.43 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.19 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.09 
 
 		 341 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.97 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 		 335 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.72 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  27.68 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.45 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.17 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.17 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.2 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.15 
 
 		 331 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.26 
 
 		 334 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.69 
 
 		 328 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.09 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  25.72 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 		 320 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.01 
 
 		 332 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.9 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.44 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  26.42 
 
 		 326 aa  97.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.09 
 
 		 333 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 		 342 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 		 344 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>