19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1310 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  53.07 
 
 		 231 aa  244  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  52.61 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  50.66 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  48.07 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  51.09 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  49.34 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  47.09 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  49.36 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  44 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  44.84 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  43.17 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  42.73 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.74 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  39.11 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  39.57 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  26.36 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  23.14 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3954  hypothetical protein  25.14 
 
 		 218 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>