40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0481 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0481  FHA domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  725    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4018  FHA domain-containing protein  25.39 
 
 
328 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3092  hypothetical protein  23.91 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4519  hypothetical protein  23.61 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0421  FHA domain-containing protein  30.77 
 
 
327 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.349643  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  39.73 
 
 
238 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  31.87 
 
 
146 aa  52.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  36 
 
 
145 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  31.68 
 
 
480 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  31.11 
 
 
147 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  32.5 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  32.53 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  29.27 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  32.47 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  25.27 
 
 
225 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  31.11 
 
 
251 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  36.99 
 
 
149 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  29.47 
 
 
508 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6874  FHA domain containing protein  40 
 
 
512 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  27.47 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  38.67 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  27.17 
 
 
529 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.22 
 
 
777 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  31.58 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
174 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  30.59 
 
 
152 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 
866 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  25.21 
 
 
851 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  35.21 
 
 
861 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  32.95 
 
 
866 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
162 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0749  FHA domain-containing protein  31.96 
 
 
256 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  27.97 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  29.05 
 
 
155 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0726  FHA domain containing protein  36.11 
 
 
198 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  31.11 
 
 
863 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  33.82 
 
 
414 aa  42.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  43.18 
 
 
866 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>