20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0474 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  951    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  31.63 
 
 		 541 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  36.9 
 
 		 533 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  29.59 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  32.35 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  27.37 
 
 		 548 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 		 526 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  29.63 
 
 		 551 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  31.03 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  21.15 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  36.76 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  29.67 
 
 		 533 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  29.67 
 
 		 529 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  30.95 
 
 		 534 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  26.12 
 
 		 464 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  30 
 
 		 195 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  30.68 
 
 		 470 aa  43.5  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>