147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2167 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2167  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 72 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2457  F0F1 ATP synthase subunit C  97.18 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  52.31 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  53.73 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  46.48 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  47.06 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  49.28 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  51.56 
 
 		 321 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  45.76 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  39.13 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  51.79 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.45 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  44.29 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  50.75 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  48.48 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1429  ATP synthase F0, C subunit  61.19 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0579198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  50.94 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  49.06 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.43 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  47.17 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  52.08 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  41.79 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 		 73 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  47.17 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  41.03 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 		 79 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.19 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  43.64 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  31.88 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  39.13 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  39.71 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.24 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  44.44 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>