67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0144 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  100 
 
 
724 aa  1448    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  87.6 
 
 
725 aa  1263    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  35.64 
 
 
3392 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  35.11 
 
 
3486 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  35.11 
 
 
3333 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  35.11 
 
 
3393 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  35.29 
 
 
3190 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  34.92 
 
 
3210 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  32.8 
 
 
882 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  34.12 
 
 
969 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  34.12 
 
 
969 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.65 
 
 
971 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  30.89 
 
 
1804 aa  72  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  34.59 
 
 
3242 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  32.24 
 
 
1508 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  27.37 
 
 
920 aa  67.8  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.37 
 
 
1328 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  26.03 
 
 
771 aa  65.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  32.2 
 
 
1066 aa  65.1  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  32.29 
 
 
1307 aa  64.7  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  27.51 
 
 
1093 aa  63.9  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  27.63 
 
 
729 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  29.17 
 
 
928 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.06 
 
 
1112 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  29.19 
 
 
1102 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  27.56 
 
 
745 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  27.27 
 
 
853 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  27.16 
 
 
731 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  26.98 
 
 
1093 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  27.51 
 
 
1055 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  27.23 
 
 
718 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  25.42 
 
 
4881 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.05 
 
 
2179 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  24.5 
 
 
718 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  28.05 
 
 
714 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  23.79 
 
 
718 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  27.81 
 
 
627 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  27.81 
 
 
627 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  28.48 
 
 
627 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  30.43 
 
 
2136 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.22 
 
 
508 aa  52.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  28.71 
 
 
495 aa  53.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30 
 
 
2272 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  27.43 
 
 
1195 aa  50.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  26.67 
 
 
1888 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  30 
 
 
4909 aa  50.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  34.75 
 
 
563 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  28.92 
 
 
1888 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  27.5 
 
 
1256 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  24.83 
 
 
1429 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  40 
 
 
1108 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  30 
 
 
540 aa  48.5  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  34.04 
 
 
563 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  24.23 
 
 
1207 aa  47.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1355  Cna B domain protein  26.49 
 
 
751 aa  47.8  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000416795  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1487  Cna B domain protein  30.85 
 
 
610 aa  47.4  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5388  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31 
 
 
564 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  25.3 
 
 
1266 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  27.16 
 
 
539 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  33.15 
 
 
913 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1453  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.13 
 
 
730 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.92 
 
 
553 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  32.17 
 
 
634 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  31.96 
 
 
563 aa  45.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5331  peptidoglycan binding protein  29.59 
 
 
564 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  30.25 
 
 
549 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5205  collagen adhesion protein, N-terminus  26.74 
 
 
617 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>