53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1704 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  97.83 
 
 		 323 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  36.05 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  27.34 
 
 		 153 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  38.46 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  38.64 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  32.29 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  35.96 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  25.86 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1535  hypothetical protein  32.14 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  29.2 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  30.17 
 
 		 146 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  32.88 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  37.1 
 
 		 94 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  30.58 
 
 		 143 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  34.18 
 
 		 131 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00316241  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  31.03 
 
 		 127 aa  46.2  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  31.03 
 
 		 127 aa  46.2  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  28.87 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  32.73 
 
 		 120 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  34.18 
 
 		 121 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  26.04 
 
 		 124 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  32.91 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  43.14 
 
 		 144 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  32 
 
 		 139 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  28.3 
 
 		 116 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  38.98 
 
 		 124 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  44 
 
 		 130 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  45.71 
 
 		 98 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  36.51 
 
 		 150 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  42.7  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  40.91 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  45.71 
 
 		 98 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>