36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00560 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB02930    96.38 
 
 		 6690 bp  2486    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    98.87 
 
 		 12648 bp  2510    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    99.35 
 
 		 1707 bp  1770    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    95.77 
 
 		 3186 bp  779    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    97.95 
 
 		 4905 bp  1063    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    97.22 
 
 		 579 bp  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    96.66 
 
 		 6546 bp  2518    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    96.55 
 
 		 2400 bp  2228    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    97.29 
 
 		 6606 bp  2151    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    96.98 
 
 		 6462 bp  1211    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    97.07 
 
 		 3063 bp  2565    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02930    97.69 
 
 		 5061 bp  7172    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108967  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02960    98.76 
 
 		 1323 bp  1812    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00543599  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02940    99.25 
 
 		 4674 bp  8950    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0953543  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    97.18 
 
 		 1917 bp  1183    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    98.29 
 
 		 5451 bp  2708    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02010    98.93 
 
 		 3753 bp  7113    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788594  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03660    98.48 
 
 		 5538 bp  1086    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    96.73 
 
 		 7809 bp  2526    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    98.71 
 
 		 7383 bp  3921    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    98.7 
 
 		 11454 bp  3338    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    96.59 
 
 		 5544 bp  2510    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00500    99.09 
 
 		 1650 bp  3148    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  98.84 
 
 		 4245 bp  2771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    95.67 
 
 		 7164 bp  2192    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    97.36 
 
 		 534 bp  942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    98.84 
 
 		 10638 bp  2771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    100 
 
 		 9432 bp  18700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    98.57 
 
 		 4092 bp  2482    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02020    98.62 
 
 		 2097 bp  3919    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602366  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    99.46 
 
 		 4911 bp  357  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    89.22 
 
 		 7155 bp  262  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    98.63 
 
 		 2397 bp  137  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    96.88 
 
 		 5637 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    96.88 
 
 		 5499 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    96.88 
 
 		 6336 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>