14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01300 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ01300  conserved hypothetical protein  100 
 
 
760 aa  1564    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00232907  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2458  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  28.82 
 
 
377 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0995914 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29618  predicted protein  22.44 
 
 
744 aa  57.4  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_89032  predicted protein  25.93 
 
 
683 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.356102  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19174  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.93 
 
 
629 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30981  predicted protein  25.62 
 
 
439 aa  54.7  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116585  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31572  predicted protein  23.35 
 
 
536 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29142  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  25.32 
 
 
632 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00572015  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05560  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 
1317 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25441  pentatrichopeptide repeat (PPR) protein  26.05 
 
 
739 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.224466  normal  0.223836 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25918  predicted protein  26.05 
 
 
739 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.304205  normal  0.0200478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2266  pentapeptide repeat-containing protein  25.76 
 
 
1225 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47986  predicted protein  21.62 
 
 
712 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50546  predicted protein  25.31 
 
 
705 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>