More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00740 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.41 
 
 
274 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 
272 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.05 
 
 
271 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.5 
 
 
280 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.05 
 
 
257 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.72 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.17 
 
 
270 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.15 
 
 
272 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.06 
 
 
276 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.98 
 
 
272 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.07 
 
 
272 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.61 
 
 
272 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.16 
 
 
272 aa  158  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.67 
 
 
266 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.33 
 
 
266 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.61 
 
 
272 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.79 
 
 
272 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.63 
 
 
270 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
272 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
272 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
272 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
272 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  43.63 
 
 
289 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.79 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 
264 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.73 
 
 
282 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.16 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.29 
 
 
275 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.18 
 
 
279 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 
269 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.98 
 
 
270 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.66 
 
 
274 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.97 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.78 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.63 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.87 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.68 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.36 
 
 
263 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.96 
 
 
276 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.96 
 
 
276 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
274 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.09 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.75 
 
 
264 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.93 
 
 
281 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.16 
 
 
264 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.92 
 
 
270 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.01 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.72 
 
 
270 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.22 
 
 
266 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.95 
 
 
270 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
267 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.44 
 
 
270 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.48 
 
 
260 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.37 
 
 
267 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.48 
 
 
260 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.5 
 
 
545 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.48 
 
 
272 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  32 
 
 
269 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.43 
 
 
275 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.62 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.57 
 
 
272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.82 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.28 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  40.8 
 
 
276 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 
271 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.13 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.32 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  31.23 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.23 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.9 
 
 
269 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.89 
 
 
269 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.92 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.9 
 
 
269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  40.4 
 
 
289 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.61 
 
 
263 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.41 
 
 
271 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.89 
 
 
267 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.63 
 
 
267 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.7 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04355  hypothetical pyrroline-5-carboxylate reductase (Eurofung)  33.22 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.05 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.65 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.39 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.64 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>