84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07110 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07110  expressed protein  100 
 
 
561 aa  1143    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0326865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  23.61 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  23.81 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  23.58 
 
 
415 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  23.61 
 
 
415 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  23.81 
 
 
415 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  22.12 
 
 
416 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  22.12 
 
 
416 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  27.41 
 
 
445 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  22.12 
 
 
416 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  23.28 
 
 
415 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  24.14 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  22.12 
 
 
416 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  36.36 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  33.66 
 
 
436 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  22.75 
 
 
415 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  22.49 
 
 
415 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  25.95 
 
 
465 aa  57  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  24 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  24 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  29.81 
 
 
417 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  24.8 
 
 
421 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  30.28 
 
 
462 aa  54.3  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  31.07 
 
 
416 aa  54.3  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  25.06 
 
 
420 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  30.19 
 
 
445 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  34.02 
 
 
451 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  20.66 
 
 
416 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04371  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 
652 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000148092  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  20.66 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  36.36 
 
 
445 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  30.61 
 
 
434 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  20.89 
 
 
416 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  22.83 
 
 
877 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  20.37 
 
 
426 aa  50.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  22.42 
 
 
417 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  28.51 
 
 
425 aa  50.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
435 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  26.4 
 
 
458 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  23.16 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  33 
 
 
461 aa  50.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  24 
 
 
417 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  24.29 
 
 
428 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  21.39 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  36.84 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  33 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  20.16 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  22.32 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  28.44 
 
 
409 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  27.72 
 
 
454 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  29.82 
 
 
462 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
439 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  20.49 
 
 
436 aa  47.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  30.1 
 
 
433 aa  47.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  21.96 
 
 
434 aa  47.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  29.36 
 
 
570 aa  47  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  32.04 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
570 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  21.3 
 
 
422 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  45.1 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  28.85 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  29.17 
 
 
423 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  26.04 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  29.41 
 
 
461 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5617  flavin-containing amine oxidase  28.57 
 
 
432 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  41.67 
 
 
435 aa  44.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
434 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
430 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  29.63 
 
 
441 aa  44.3  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  36.47 
 
 
647 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  30.77 
 
 
439 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  61.76 
 
 
645 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  28.57 
 
 
447 aa  43.9  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  31.96 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  39.58 
 
 
417 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  61.76 
 
 
647 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  61.76 
 
 
647 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  25.89 
 
 
437 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 
437 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  25 
 
 
437 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>