122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0462 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  100 
 
 		 439 aa  897    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  66.05 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  66.19 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  63.79 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  65.96 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  62.99 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  58.64 
 
 		 457 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  54.65 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  53.53 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  54.25 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  54.01 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  53.43 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  48.21 
 
 		 462 aa  425  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  53.35 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  45.12 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  49.66 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  45.01 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  44.77 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  46.01 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  48.36 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  46.5 
 
 		 433 aa  362  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  49.53 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  47.88 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  45.54 
 
 		 416 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  46.95 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  48.93 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  45.54 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  45.54 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  46.7 
 
 		 451 aa  355  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  48.95 
 
 		 415 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  44.13 
 
 		 416 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  45.5 
 
 		 461 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  44.1 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  43.9 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  48.85 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  45.33 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  45.67 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  45.01 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  47.79 
 
 		 415 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  47.79 
 
 		 415 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  45.88 
 
 		 417 aa  346  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  44.73 
 
 		 415 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  45.37 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  46.4 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  47.42 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  46.24 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  43.66 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  43.33 
 
 		 422 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  44.34 
 
 		 416 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  45.67 
 
 		 409 aa  341  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  43.82 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  43.16 
 
 		 423 aa  339  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  42.86 
 
 		 418 aa  339  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  46.59 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  44.47 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  42.35 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  42.46 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  44.37 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  41.51 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  43.59 
 
 		 462 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  43.19 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  45.5 
 
 		 447 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 		 570 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  44.42 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  44.16 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  43.55 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  44.16 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  39.02 
 
 		 570 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  42.59 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  44.34 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  42.36 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  45.84 
 
 		 414 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  39.96 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  42.46 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  40.22 
 
 		 877 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  40.8 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  41.22 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  41.53 
 
 		 437 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  42.09 
 
 		 428 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  42.04 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  39.06 
 
 		 422 aa  296  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  40.33 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  42.17 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  33.98 
 
 		 577 aa  292  9e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  41.1 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  38.59 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  41.59 
 
 		 421 aa  285  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  41.84 
 
 		 667 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  39.68 
 
 		 465 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  39.53 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  41.61 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  41.33 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  36.92 
 
 		 949 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  37.95 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>