More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0893 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0823  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 462 aa  940    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.449834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0893  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 462 aa  940    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1208  cysteinyl-tRNA synthetase  96.97 
 
 		 462 aa  914    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0630  cysteinyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 460 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.347477  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0788  cysteinyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 459 aa  519  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0413015  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1054  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 459 aa  339  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 472 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 468 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 456 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 485 aa  329  8e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 459 aa  322  6e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 494 aa  322  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 458 aa  322  9.000000000000001e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  37.47 
 
 		 485 aa  319  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 449 aa  317  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 479 aa  316  6e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 462 aa  316  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 461 aa  316  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 461 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 455 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 454 aa  312  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 461 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 457 aa  310  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 481 aa  310  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1008  cysteinyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0156033  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 488 aa  309  8e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 461 aa  309  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 461 aa  309  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 505 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 485 aa  306  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 485 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 460 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  35.7 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>